Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh3P13705 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh3P13705 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh3P13705 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms