Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf4P11403 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms