Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx8O88983 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx8O88983 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx8O88983 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx8O88983 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms