Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klc1O88447 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klc1O88447 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klc1O88447 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc1O88447 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc1O88447 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc1O88447 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc1O88447 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms