Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
StrnO55106 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
StrnO55106 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StrnO55106 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StrnO55106 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StrnO55106 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StrnO55106 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StrnO55106 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StrnO55106 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StrnO55106 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StrnO55106 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StrnO55106 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
StrnO55106 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
StrnO55106 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StrnO55106 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StrnO55106 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StrnO55106 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
StrnO55106 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
StrnO55106 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
StrnO55106 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
StrnO55106 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
StrnO55106 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
StrnO55106 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
StrnO55106 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StrnO55106 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StrnO55106 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
StrnO55106 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StrnO55106 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
StrnO55106 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StrnO55106 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StrnO55106 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
StrnO55106 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
StrnO55106 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
StrnO55106 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
StrnO55106 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
StrnO55106 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StrnO55106 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
StrnO55106 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
StrnO55106 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms