Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psmb10O35955 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb10O35955 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms