Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms