Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc13D3YV10 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms