Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms