Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpb1B2RS76 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpb1B2RS76 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpb1B2RS76 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpb1B2RS76 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpb1B2RS76 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpb1B2RS76 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpb1B2RS76 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpb1B2RS76 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms