Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp42B2RQC2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp42B2RQC2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms