Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox1B1APN4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rhox1B1APN4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhox1B1APN4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhox1B1APN4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms