Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ramp3Q9WUP1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ramp3Q9WUP1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms