Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms