Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plod3Q9R0E1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms