Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsfQ9R013 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms