Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnb3Q9QY40 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plxnb3Q9QY40 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms