Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms