Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herpud1Q9JJK5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herpud1Q9JJK5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms