Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIY8

Cml3, Probable N-acetyltransferase CML3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml3Q9JIY8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml3Q9JIY8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml3Q9JIY8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms