Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms