Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fsip1Q9D3V5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fsip1Q9D3V5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fsip1Q9D3V5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms