Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpinb3bQ9D1Q5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpinb3bQ9D1Q5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms