Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms