Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Use1Q9CQ56 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Use1Q9CQ56 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms