Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf34Q99KR6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms