Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ophn1Q99J31 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms