Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf4Q91XD3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf4Q91XD3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf4Q91XD3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf4Q91XD3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms