Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms