Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam20bQ8VCS3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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