Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GcaQ8VC88 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GcaQ8VC88 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms