Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd109Q8R422 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cd109Q8R422 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cd109Q8R422 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms