Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spire2Q8K1S6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms