Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrit1Q8K099 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms