Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms