Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc50Q810U5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms