Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms