Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFH3

Dcaf15, DDB1- and CUL4-associated factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf15Q6PFH3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dcaf15Q6PFH3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcaf15Q6PFH3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dcaf15Q6PFH3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms