Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac4Q6NZM9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms