Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM3

Tmem130, Transmembrane protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem130Q6NXM3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem130Q6NXM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem130Q6NXM3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem130Q6NXM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms