Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn11Q6J756 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn11Q6J756 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn11Q6J756 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms