Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cln3Q61124 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cln3Q61124 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms