Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms