Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim58Q5NCC9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim58Q5NCC9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim58Q5NCC9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms