Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpf38aQ4FK66 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf38aQ4FK66 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms