Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms