Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap1Q3UUV5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms