Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctu2Q3U308 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu2Q3U308 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms