Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms