Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bpifa6Q0VGU8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bpifa6Q0VGU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms